1979—1983年，本科畢業(yè)于上海鐵道大學(xué)（現(xiàn)同濟(jì)大學(xué)）電氣工程系獲工學(xué)士學(xué)位。

1983—1986年，任鐵道部資陽內(nèi)燃機(jī)車廠柴油機(jī)分廠助理工程師。

1986—1999年，任西南政法大學(xué)司法鑒定中心助理工程師、研究員。

1989—1992年，就讀于英國Strathclyde大學(xué)并獲司法生物學(xué)博士學(xué)位。曾先后在英國Strathclyde大學(xué)、Aberdeen大學(xué)、美國Pennsylvania大學(xué)從事博士后研究，1996—2000年先后任Pennsylvania大學(xué)醫(yī)學(xué)院研究助理教授，美國Nanogen公司資深科學(xué)家暨工程師（Staff Scientist/Engineer）、首席科學(xué)家暨工程師（Principal Scientist/Engineer）及首席研究員（Principal Investigator），美國AVIVA公司技術(shù)總監(jiān)。

1999年，獲國家杰出青年科學(xué)基金。

2009年，獲中國工程院院士稱號。

1999年3月，正式回國至今先后任清華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)系教授、博士生導(dǎo)師、生物芯片研究與開發(fā)中心主任，教育部長江學(xué)者計(jì)劃特聘教授，生物芯片北京國家工程研究中心主任，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系和醫(yī)學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)研究中心教授、博導(dǎo)、博奧生物集團(tuán)有限公司總裁。

2017年6月29日，中國民主建國會北京市第十一次代表大會勝利閉幕，民建北京市第十一屆委員會第一次全體會議選舉程京為副主任委員。 ^[3] 

第十三屆全國人民代表大會北京團(tuán)代表 ^[4]  。

2017年12月20日，程京被選為中國民主建國會第十一屆中央委員會常務(wù)委員。 ^[5] 

2018年1月30日，在北京市第十五屆人民代表大會第一次會議上，當(dāng)選為北京市出席第十三屆全國人民代表大會代表。 ^[4] 

程京教授從事醫(yī)學(xué)生物物理研究27年。1994年進(jìn)入生物芯片這一工程、技術(shù)和生命科學(xué)交叉的新領(lǐng)域。1999年3月回國后在芯片設(shè)計(jì)原理、制作工藝、芯片實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)集成和配套儀器方面作了系統(tǒng)和深入的創(chuàng)新性研究，并針對基礎(chǔ)和臨床醫(yī)學(xué)所需開發(fā)出系列新技術(shù)和產(chǎn)品，產(chǎn)生了明顯的社會和經(jīng)濟(jì)效益。

回國前，發(fā)明2項(xiàng)核酸萃取技術(shù)并參與開發(fā)出3個(gè)產(chǎn)品，由GE Healthcare等全球銷售20余年。首次在國際上研究完成集血液中細(xì)菌分離、胞解及雜交檢測為一體的芯片實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)，1998年該成果以Lab on a Chip為封面文章發(fā)表在Nature Biotechnology上，并被Science當(dāng)年世界十大科技突破所引用。

1999年3月回國后，為攻克生物芯片設(shè)計(jì)制作中對檢測精度、重復(fù)性、通量及價(jià)格三高一低要求長期面臨的難題，深入研究了芯片親和反應(yīng)新機(jī)制、表面化學(xué)、微加工及微樣印制均一性等關(guān)鍵技術(shù)，建立了5類共性創(chuàng)新技術(shù)：①基于標(biāo)簽技術(shù)的突變檢測芯片技術(shù)。②基于寡核苷酸芯片的蛋白活性檢測技術(shù)。③檢測小分子藥物的蛋白芯片競爭免疫分析技術(shù)。④提高芯片檢測精度和重復(fù)性的雜交蓋片和特殊點(diǎn)樣液技術(shù)。⑤無標(biāo)記、實(shí)時(shí)、定量、高通量細(xì)胞芯片監(jiān)測技術(shù)。基于這五類技術(shù)研制出面向臨床和科研兩大類生物芯片如下：建立了用于疾病預(yù)防、診斷及預(yù)后的快速、高通量分子分型芯片技術(shù)體系；研制出多項(xiàng)具有無標(biāo)記、高通量檢測特點(diǎn)的細(xì)胞芯片實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)。

主持過國家杰出青年基金和十五重大專項(xiàng)等項(xiàng)目。在Nature Biotechology、Nature Communications等雜志發(fā)表SCI論文140余篇，SCI他引7300余次 ^[6]  ，回國后主編中英文著作各4部，其中《Biochip Technology》為國際該領(lǐng)域第一部英文專著。4次作主席主辦國際生物芯片大會，為Human Mutation（IF 5.05）通訊編輯。獲國際發(fā)明專利119項(xiàng)，國內(nèi)發(fā)明專利118項(xiàng) ^[6]  ；主持獲批醫(yī)療器械注冊證及一類備案58項(xiàng)，歐盟CE認(rèn)證證書30個(gè)；獲批臨床診斷類生物芯片行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)7項(xiàng)、國家標(biāo)準(zhǔn)10項(xiàng) ^[6]  。回國二十余年，在生物芯片產(chǎn)業(yè)化方面做了大量工作，開發(fā)出相關(guān)產(chǎn)品70余項(xiàng)，產(chǎn)品批量出口歐美十國數(shù)百家醫(yī)院和若干科研機(jī)構(gòu)，累計(jì)實(shí)現(xiàn)銷售收入超40億元。 ^[6] 

國家技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)（2007年）；全國婦幼健康科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)科技成果獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)（2015年）；黃家駟生物醫(yī)學(xué)工程獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)（2017年） ^[7]  。

程京兼任Human Mutation雜志通訊編輯、IET Nanobiotechnology雜志編委和Journal of the Association for Laboratory Automation雜志科學(xué)顧問，全國生物芯片標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會主任委員、中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會生物芯片分會主任委員、中國儀器儀表學(xué)會醫(yī)療儀器專業(yè)委員會主任委員、中國高科技產(chǎn)業(yè)化研究會生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)化工作委員會主任委員、中國醫(yī)院協(xié)會臨床檢驗(yàn)專業(yè)分子診斷技術(shù)與質(zhì)量管理分會主任委員、國務(wù)院學(xué)位委員會生物醫(yī)學(xué)工程組第七屆學(xué)科評議組召集人、發(fā)改委國家生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展咨詢委員會專家、戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)發(fā)展專家咨詢委員會委員。

程京治學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)、求實(shí)創(chuàng)新。